一、注册分公司和注册子公司的区别。
1.定义差异。
子公司是指该企业一定比例以上的股份被另一家公司所持或受到某些协议的作用被另一家公司实际控制，子公司具有法人资格，可独立承担民事责任。
分公司是总公司部下从事业务经营活动的分公司，分公司包括公司两个字，但实际上分公司不是真正意义上的公司。分公司既没有法人资格，也没有独立的法律地位，不能独立承担民事责任。
2.纳税差异。
子公司作为独立的法律主体，可以独立从事经营活动，可以单独在经营登记地税务机关缴纳企业增值税和所得税。
分公司不是独立的法律主体，也可以独立从事经营活动，可以在经营注册地支付增值税，但分公司的所得税需要统一计算总公司支付。
3.风险承担的差异。
子公司作为独立的法律主体，拥有自己的法人财产，享有独立的民事责任和民事义务，遇到经营风险，需要用自己的财产承担有限责任。
分公司不是独立的法律主体，如果出现经营风险，总公司需要承担全部责任，总公司之间的关系是无限责任。
4.表现形式不同。
子公司可以有独立的名称、章程、注册资金等。
分公司只有总公司的冠名，没有公司章程、注册资金等。
二、设立下属机构是注册分公司还是子公司？
企业开业初期，部下企业可能出现赤字，小编建议每年设立分公司。分公司和总公司的所得税计算是合并计算，因此在总公司计算时，可以减少总公司的利润，减少企业的应税，减少所得税，减少企业的所得税。
企业开设不久就能获利的话，设立子公司比较合适。子公司不仅可以享受独立法人经营的便利性，还可以享受中小企业等优惠政策，减少自己的税金支出。收益合并计算，整体税收负担支出也会增加。